Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms