Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC23Q9UJX2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms