Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5BQ9UGL1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
KDM5BQ9UGL1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5BQ9UGL1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms