Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT8Q9UFF9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms