Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG4Q9UBN1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms