Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE7

PANK4, Pantothenate kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK4Q9NVE7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PANK4Q9NVE7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PANK4Q9NVE7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PANK4Q9NVE7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PANK4Q9NVE7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PANK4Q9NVE7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PANK4Q9NVE7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PANK4Q9NVE7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PANK4Q9NVE7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PANK4Q9NVE7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PANK4Q9NVE7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PANK4Q9NVE7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PANK4Q9NVE7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PANK4Q9NVE7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PANK4Q9NVE7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PANK4Q9NVE7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PANK4Q9NVE7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PANK4Q9NVE7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PANK4Q9NVE7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PANK4Q9NVE7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PANK4Q9NVE7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PANK4Q9NVE7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PANK4Q9NVE7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PANK4Q9NVE7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PANK4Q9NVE7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PANK4Q9NVE7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms