Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms