Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms