Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms