Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAPOLBQ9NRJ5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms