Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ1

C8orf17, Protein MOST-1, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf17Q9NRJ1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C8orf17Q9NRJ1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms