Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO6Q9NRD1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms