Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
INCENPQ9NQS7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INCENPQ9NQS7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms