Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLMQ9NP87 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms