Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPCSQ9HAB8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPCSQ9HAB8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPCSQ9HAB8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms