Protein–RNA interactions for Protein: Q9H649

NSUN3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN3Q9H649 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSUN3Q9H649 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms