Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIOBPQ9H2D6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms