Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC90BQ9GZT6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms