Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms