Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C9orf16Q9BUW7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C9orf16Q9BUW7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms