Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms