Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF1Q9BQI6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms