Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF25Q9BQ70 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms