Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VGLL1Q99990 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms