Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EYA3Q99504 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms