Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCCC1Q96RQ3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms