Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms