Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PRAC1Q96KF2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms