Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFAP36Q96G28 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFAP36Q96G28 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CFAP36Q96G28 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFAP36Q96G28 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFAP36Q96G28 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFAP36Q96G28 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFAP36Q96G28 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFAP36Q96G28 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CFAP36Q96G28 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CFAP36Q96G28 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CFAP36Q96G28 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CFAP36Q96G28 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CFAP36Q96G28 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms