Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM4SF18Q96CE8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TM4SF18Q96CE8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms