Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TTC21AQ8NDW8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
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