Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD1Q8NBU5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD1Q8NBU5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD1Q8NBU5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD1Q8NBU5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD1Q8NBU5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD1Q8NBU5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD1Q8NBU5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD1Q8NBU5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD1Q8NBU5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD1Q8NBU5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD1Q8NBU5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD1Q8NBU5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD1Q8NBU5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD1Q8NBU5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD1Q8NBU5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD1Q8NBU5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD1Q8NBU5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD1Q8NBU5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD1Q8NBU5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD1Q8NBU5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD1Q8NBU5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD1Q8NBU5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms