Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms