Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNTD2Q8IXW0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms