Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms