Protein–RNA interactions for Protein: Q86W67

FAM228A, Protein FAM228A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228AQ86W67 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM228AQ86W67 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms