Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms