Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP6Q6ZN66 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms