Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HACD2Q6Y1H2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms