Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ASCL4Q6XD76 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms