Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms