Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXC1

MAMDC4, Apical endosomal glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAMDC4Q6UXC1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAMDC4Q6UXC1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
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