Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms