Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFCAB12Q6NXP0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms