Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMBOX1Q6NT76 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMBOX1Q6NT76 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMBOX1Q6NT76 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMBOX1Q6NT76 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMBOX1Q6NT76 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMBOX1Q6NT76 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMBOX1Q6NT76 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMBOX1Q6NT76 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMBOX1Q6NT76 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HMBOX1Q6NT76 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMBOX1Q6NT76 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMBOX1Q6NT76 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMBOX1Q6NT76 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMBOX1Q6NT76 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMBOX1Q6NT76 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMBOX1Q6NT76 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMBOX1Q6NT76 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms