Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 999 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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