Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LARP1BQ659C4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LARP1BQ659C4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LARP1BQ659C4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms