Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATRNL1Q5VV63 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATRNL1Q5VV63 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms