Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms