Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GKAP1Q5VSY0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms